A ce jour donc, l’équipe est constituée de 235 membres sur le World Community Grid, dont 171 sont de façon plus générales sur BOINC et calculent sur le World Community Grid et/ou d’autres projets.

Au niveau des projets, nos différents membres calculent notamment sur : AQUA@home (1,6 million de crédits), Climate Prediction (1,2 million), Collatz Conjecture, GPUGRID (2,6 millions), Ibercivis, Malaria Control, Milkyway@home (20 millions), Proteins@home, Rosetta@home, SETI@home, et le World Community Grid (9 millions), pour un total cumulé de plus de 35 millions de crédits – ce qui place l’équipe Star Wars [FR] à la 385ème position sur un total mondial de 87 805 équipes. Pas trop mal ^^.

Au niveau du World Community Grid, qui mobilise l’essentiel de l’équipe, les projets sur lesquels nous avons le plus calculé sont Help Conquer Cancer, Human Proteome Folding, et Fight Aids @ Home. Viennent ensuite Nutritious Rice for the World, Help Fight Childhood Cancer, ou encore le projet sur la dystrophie musculaire du Téléthon, le projet Help Cure Muscular Distrophy. Au total l’équipe du WCG a calculé l’équivalent de 84 années de calcul et renvoyé plus de 122 000 résultats, c’est un chiffre très important !

A toutes fins utiles je rappelle à chacun que vous pouvez utiliser la puissance inexploitée de vos ordinateurs pour aider la recherche scientifique, et encore même plus si vous disposez d’une carte graphique puissante de marque ATI ou Nvidia (la plupart des cartes graphiques sorties ces deux dernières années permettent de faire de la recherche, de manière plus efficace que sur un ordinateur « classique ». Il existe plusieurs projets qui exploitent la puissance des cartes graphiques gamer, comme GPUGRID ou MilkyWay pour ne citer que les deux plus connus.

N’hésitez pas à nous rejoindre si vous ne faites pas encore partie de l’équipe Star Wars [FR], et si vous avez des questions ou des problèmes, n’hésitez pas non plus à en parler ici

Pour le moment la première étape de ce « nouveau » projet ne contient que des unités de très grande taille, et en nombre très réduit. Il vous sera donc très difficile, voire impossible,  de vous en procurer.

Une fois cette première étape terminée, le projet partira sur un rythme de croisière plus normal et les unités devraient être disponibles comme sur n’importe quel autre projet du WCG…

Et tout comme pour la phase 2 du projet « Help Cure Muscular Distrophy », il semblerait que les graphistes se soient donnés beaucoup de mal pour concevoir ces nouveaux badges ^^

DDDT – Phase 1 :

DDDT – Phase 2 :

Oui je sais, c’est d’une grande originalité

Les unités beta pour ce projet sont actuellement en cours, vous tomberez peut-être dessus si vous avez de la chance

Au total, les personnes ayant calculé sur ce projet ont fourni pas moins de 12.000 années de temps de calcul.L’équipe Star Wars [FR] a apporté sa modeste contribution avec un peu plus de 5 années de calcul, soit environ 0.04% du total (ça semble peu mais c’est déjà pas trop mal je trouve ^^).

Rendez-vous prochainement pour la deuxième phase du projet ^^

L’application CUDA pour Windows 32 bits est déployée sur Boinc. Il est nécessaire de posséder un GPU Nvidia compatible avec la version 1.3 de CUDA, ce qui inclue les GPU suivants : GeForce GTX 295, 285, 280, 260, Tesla S1070, C1060, Quadro Plex 2200 D2, Quadro FX 5800, 4800. Il faut également 256 Mo de RAM minimum sur la carte, ainsi que les drivers Nvidia 190.xx ou plus récent. Si votre configuration remplit les trois conditions ci-dessus, l’application CUDA sera automatiquement téléchargée par BOINC si vous êtes rattaché au projet Milkyway@Home.

Par ailleurs, une nouvelle option a été ajoutée dans les préférences de votre espace personnel en ligne, indiquant si le projet est autorisé ou non à utiliser votre GPU. Vérifiez bien que cette option soit activée. Cela n’a aucune influence pour les personnes qui utilisent l’application optimisée compatible ATI.

Durant les calculs GPU effectués par BOINC, il est probable que votre système d’exploitation connaisse des ralentissements notables. Il est possible, dans les préférences de BOINC, de spécifier que le GPU ne doit pas être utilisé pendant que le PC est utilisé.

A little more news on the server software upgrade. We’re upgrading it to put allow us to correctly recognize NVidia and ATI graphics cards, which means the applications we supply will be able to support those GPUs.

En bon Français : le serveur de Milkyway@Home est en cours de mise à jour afin de pouvoir reconnaître convenablement les cartes graphiques ATI et Nvidia, ce qui permettra à l’application du projet de fournir des unités de travail pour les GPU supportés des deux marques.

Voila une bonne nouvelle pour les propriétaires de GeForce ^^

Auparavant il y avait ça :

• Bronze – 14 days
• Silver – 45 days
• Gold – 90 day

Et maintenant il y a ça en plus :

• Ruby – 180 days
• Emerald – 1 year
• Sapphire – 2 years

Personnellement je trouve que c’est une excellente idée, car ici comme ailleurs, la « course aux points/rangs/badges/récompenses » tourne à plein régime, et beaucoup de personnes arrêtaient de calculer sur certains projets une fois qu’elles avaient le badge en or (dont votre serviteur, sur les projets qui ne m’emballaient pas plus que ça).

Voila qui devraient permettre aux « anciens projets » de connaitre un regain d’activité, à n’en pas douter !

Enfin, personnellement, moi je reste à fond sur Help Cure Muscular Dystrophy – Phase 2 ^^

cela fait déjà un bon moment que je n’avais plus publié d’article, faute de temps, mais l’actualité du calcul partagé et de l’équipe ne s’est pas arrêté, elle. Voici donc les dernières informations, un peu en vrac, sur divers points :

Projet Milkyway@home et calcul GPU : l’arlésienne a enfin montré le bout de son nez, et il semblerait que le projet Milkyway soit désormais totalement opérationnel pour les possesseurs de cartes graphiques Nvidia et ATI. je vous signale d’ailleurs la sortie d’une nouvelle version de l’optimisation (http://www.zslip.com, version 0.19f). J’utilise le tout depuis 2 jours, on dirait a priori que ça fonctionne plutôt bien, avec un flot constant d’unités et des scores tout à fait intéressants (environ 3.600 – 4.000 par heure sur une Radeon HD 4850 + optimisation).

Equipe Star Wars [FR] : plusieurs nouvelles importantes pour l’équipe ces derniers temps, comme vous allez pouvoir le constater.

- les 8 millions de points, touts projets confondus, ont été atteints le 9 juin;

- le million de points a été atteint sur chacun des deux principaux projets GPU, à savoir GPUGRID et Milkyway@home, avec un très léger avantage pour le dernier ^^ C’est véritablement LE match interne à l’équipe, car les scores sont très serrés depuis plusieurs semaines. Si vous avez une carte graphique capable de calculer sur l’un des deux projets, n’hésitez pas à venir participer à la course aux crédits ^^

- l’équipe est désormais active sur un nouveau projet médical grâce à Ipox : Rosetta@Home. Ce projet compte déjà quelques 35.000 crédits environ;

BOINC : la version recommandée est désormais la 6.6.36, dont voici les liens :
boinc_6.6.36_x86_64-pc-linux-gnu.sh (3.9 Mo)
boinc_6.6.36_i686-pc-linux-gnu.sh (4.6 Mo)
boinc_compat_6.6.36_i686-pc-linux-gnu.sh (1.1 Mo)
boinc_6.6.36_windows_x86_64.exe (6.9 Mo)
boinc_6.6.36_windows_intelx86.exe (6.4 Mo)

La seconde bonne nouvelle pour les possesseurs de cartes Nvidia, c’est qu’après plusieurs tests il s’avère que les calculs en simple précision, qui semblaient inadaptés au projet, peuvent en fait suffire. Concrètement cela signifie que toutes les cartes Nvidia compatibles CUDA pourront calculer sur Milkyway, et pas seulement les GTX comme c’était annoncé au départ !

A titre d’exemple, Travis annonce une durée d’une minute pour calculer une unité série 82, sur une carte 9600M GT, une bonne performance pour une carte graphique d’ordinateur portable qui plus est !

Travis va très prochainement poster le code pour qu’il soit adapté aux cartes graphiques ATI !

Reste à voir dans les prochains jours si l’afflux d’unités de travail sera suffisant pour satisfaire tout le monde

Si vous avez des cartes graphiques Nvidia (ou ATI quand l’optimisation sera disponible),  merci de tester de votre côté et de donner vos scores ^^

Quant à moi j’attends patiemment l’opti ATI pour voir ce que ça donne avec ma Radeon HD 4850 …

Le World Community Grid et les chercheurs parrainés par Décrypthon, un partenariat entre l’AFM, le CNRS, Universite Pierre et Marie Curie et IBM, étudient les interactions entre plus de 2200 protéines dont les structures sont connues, avec un accent mis sur les protéines qui ont un rôle dans les maladies neuromusculaires. La base de données contenant les informations produites aidera les chercheurs à élaborer des molécules pour inhiber ou améliorer l’association de certaines macromolécules, ce qui pourrait améliorer les traitements des myopathies et des autres maladies neuromusculaires.

Que sont les maladies neuromusculaires et la myopathie de Duchenne ?

Le terme générique « maladie neuromusculaire » désigne un groupe de maladies (plus de 200 au total) qui affectent le fonctionnement des muscles, soit en touchant directement le muscle (dystrophie musculaire), soit indirectement en touchant le nerf moteur ou la jonction entre le nerf et le muscle. La plupart de ces maladies sont rares (moins d’une personne sur 2 000 est affectée), elles sont d’origine génétique (80% des cas) et affectent aussi bien les enfants que les adultes. Ces maladies chroniques conduisent à une diminution de la force musculaire et occasionnent un handicap sévère de la fonction motrice (mouvements, respiration, etc.). Les manifestations de ces maladies sont variables. Certaines sont progressives alors que d’autres peuvent rester stables durant plusieurs années. De plus, la même pathologie peut produire des symptômes différents d’une personne à l’autre.

Malgré les avancées des approches thérapeutiques, il n’existe à ce jour aucun traitement curatif disponible de ces maladies.

Et voici le message d’introduction d’Alessandra Carbone, responsable du projet :

Bienvenue dans la seconde phase du projet Lutte contre les Dystrophies Musculaires (HCMD2).

Afin de comprendre comment les protéines remplissent leur fonction biologique dans les cellules, il est nécessaire de mieux comprendre en détail les modes d’interactions entre protéines dans le but d’aider les chercheurs à développer de nouvelles stratégies thérapeutiques.

HCMD2 va analyser une large base de données de protéines humaines et passer celles-ci au crible afin de chercher parmi elles des partenaires protéiques potentiels in vivo. Une partie des 2200 structures protéiques que votre ordinateur va contribuer à analyser concerne des molécules impliquées dans les dystrophies musculaires, une autre partie des ces protéines joue un role important dans divers tissus ou organes comme le coeur ou le cerveau. La première phase du projet nous a permis de développer et tester une méthode qui permet de discriminer les partenaires protéiques des paires de protéines qui n’interragissent pas ensemble (à partir d’un ensemble dont les interactions expérimentales sont connues). La seconde phase va appliquer cette méthode numérique à des protéines dont on ignore les interactions afin de découvrir de nouveaux partenaires potentiels. Chaque unité de calcul résolue durant la phase 2 nous apportera des informations sur le mode d’interaction de deux protéines parmi les 2200 étudiées.

Votre contribution à ce projet apportera des informations importantes aux biologistes et aux physiciens, et à terme bénéficiera à tous les chercheurs qui travaillent sur des maladies génétiques et en particulier les maladies neuromusculaires. Au final nous espérons contribuer au développement de thérapies innovantes qui aboutiront à un traitement de la grande majorité des maladies neuromusculaires, y compris les dystrophies musculaires.

Beaucoup d’entre vous ont déja résolu des unités de calcul lors de la première phase du projet, qui a été un succès et nous a beaucoup appris. Une grande partie de ce succès revient naturellement aux participants de la phase 1. Avec le démarrage de la phase 2, nous souhaiterions remercier tous les gens qui apportent leur contribution à HCMD2 en donnant du temps de calcul au projet et à World Community Grid.